不審船を追跡しているときに、一番手のあいている部署はどこでしょうか？
射撃員と射管員は大砲の方がありますし、運用も応急部署の方に配置されています。あとに残るのは、水測と魚雷です。
状況にもよるのでしょうが、機関銃は魚雷と水測で担当するのではないかと思います。
エボリツォーネ

自衛艦には、各艦ごとに「部署」と言う物が定められています。
（射撃、射管、水測と言った職種ごとの配置は、内部では「パート」と言っています。）
出港部署、応急部署、戦闘部署、臨検部署、短艇武装部署、総員離艦部署といった具合です。
これらは、状況に応じた人員配置を個艦で定めたものなので、全く同じ内容の「部署」を複数の艦が定めているとは限りません。
ただし、ご質問の内容を考えますと、まず最低１名は射撃員（海曹）が含まれると思われます。
（小火器の所掌は砲雷科の中でも、射撃であるのが通常。射撃員の配置の無い艦では運用です。）
通常、短艇武装部署でも、射手を始めとして３〜４名の配置となりますので、残りの人員は、「部署」に従って砲雷科の各パートから抽出される事になると思われます。
元むらくも乗員

ちょっと解り難かったかも知れませんので、具体的な例を。
某艦の「短艇武装部署」はこんな感じでした。

１．艇指揮　　　　　　掌砲術士。
２．射手　　　　　　　射撃員（３曹）１名。
３．予備射手　　　　　水測、魚雷、射撃管制（海士）各１名。
４．短艇操縦要員　　　出入港部署に準ずる。
５．短艇降下揚収要員　出入港部署、中部作業員に準ずる。
６．その他　　　　　　特令無き場合は艦内哨戒部署第１配備に準ずる。

ここに出てくる「準ずる」は、「減員操法で対応せよ」と言うことを意味しています。　
元むらくも乗員

回答ありがとうございました。なかなか難しい話でしたが「射撃員」が担当するという事が大体理解できました。ところでふと思ったんですが、最近「CIWS」のレーダーを改良して不審船などにも対処できる様にする計画がありますね。実現化すれば機関銃の出番が減りそうですな・・・
マーフィー